日本政府現只承認世界衞生組織(WHO)新冠疫苗緊急使用清單中所列的疫苗,即輝瑞(復必泰)、阿斯利康(AstraZeneca)、莫德納(Moderna)、強生(Johnson & Johnson)、印度巴拉特(Bharat Biotech)及諾瓦瓦克斯(Novavax)。頭兩針可以是以上其中一款,第三針必須是輝瑞、莫德納或諾瓦瓦克斯。
10月11日後,日本新接納科興疫苗(Sinovac)、印度血清研究所Covishield疫苗、印度血清研究所COVOVAX疫苗、國藥中生(北京)(Sinopharm/Beijing Institute of Biological Products)、康希諾生物腺病毒載體疫苗(CanSinoBIO Convidecia)獲當地承認,令認可疫苗數目新增至11種。