王弘毅補充,這項研究使用蝙蝠的序列當作外群。蝙蝠的序列與新冠病毒序列變異度差了3.6%。冠狀病毒的序列全長大約3萬個鹼基,3.6%的差異就是差了大約1000個鹼基。而任兩個新冠病毒的序列差異大約2-3個鹼基。也就是說,蝙蝠的基因離現在的新冠病毒還是很遠,因此蝙蝠的序列不能用來當作祖先指定演化方向。
王弘毅舉例說明,人類雖然跟黑猩猩在DNA變異的層次上只差了1%,但是除了很少數例外,一般而言黑猩猩不能拿來當作人類序列的祖先。這就像拿十個人類的基因與黑猩猩的基因去比,然後說某個人的基因比較接近黑猩猩,一樣是沒有意義的。
王弘毅說明,這張圖將病毒變異分成A、B、C、D、E五種「Group(家族)」,但這幾個「家族」缺乏統計的定義,因此不能用這五個分類去判斷病毒的起源。